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微生物培養基可根據成分、物理狀態及用途等標準進行詳細分類，以下是具體分類及說明：

按化學成分分類

1. 天然培養基：利用動、植物或微生物的原料制成，成分難以確切知道，如牛肉膏蛋白胨培養基、麥芽汁培養基等。這類培養基營養豐富，微生物生長旺盛，來源廣泛，配制方便，但穩定性常受生產廠或批號等因素的影響，自養微生物一般不能在其上面生長。

2. 合成培養基：由已知化學成分的化學藥品配制而成，成分和數量清楚，如高氏一號合成培養基、察氏（Czapek）培養基等。這類培養基化學成分精確、重復性強，但價格昂貴，微生物生長緩慢，適用于科學研究，如營養、代謝的研究。

3. 半合成培養基：在合成培養基中加入某種或幾種天然成分，或者在天然培養基中加入一種或幾種已知成分的化學藥品制成，如馬鈴薯蔗糖培養基等。這類培養基兼具天然培養基和合成培養基的特點，應用廣泛。

按物理狀態分類

1. 固體培養基：在培養基中加入凝固劑（如瓊脂、明膠、硅膠等）制成，常用于微生物分離、鑒定、計數和菌種保存等方面。

2. 半固體培養基：在液體培養基中加入少量凝固劑而呈半固體狀態，可用于觀察細菌的運動、鑒定菌種和測定噬菌體的效價等方面。

3. 液體培養基：不加任何凝固劑，根據培養基的營養成分來區分，可以分為基本培養基、全培養基和補充培養基。這類術語主要是用在微生物遺傳學中。

按用途分類

1. 基礎培養基：含有一般微生物生長繁殖所需基本營養物質的培養基，如牛肉膏蛋白胨培養基，用于培養大多數未明確營養要求的微生物。

2. 加富培養基：在基礎培養基中加入血、血清、動植物組織提取液制成的培養基，用于培養要求比較苛刻的某些微生物。

3. 選擇性培養基：在普通培養基中加入特殊營養物質或化學物質，以抑制不需要的微生物的生長，有利于所需微生物的生長，用于將某種或某類微生物從混雜的微生物群體中分離出來。

4. 鑒別培養基：在培養基中加入某種試劑或化學藥品，使培養后會發生某種變化，從而區別不同類型的微生物，如鑒別大腸桿菌的伊紅美藍培養基。

按微生物種類分類

1. 細菌培養基：如營養肉湯和營養瓊脂培養基，用于培養細菌。

2. 放線菌培養基：如高氏1號培養基，用于培養放線菌。

3. 酵母菌培養基：如馬鈴薯蔗糖培養基和麥芽汁培養基，用于培養酵母菌。

4. 霉菌培養基：如馬鈴薯蔗糖培養基、豆芽汁蔗糖（或葡萄糖）瓊脂培養基和察氏培養基等，用于培養霉菌。

其他特殊類型

1. 厭氧培養基：用于培養厭氧菌和微需氧菌，如庖肉培養基、Brewer厭氧菌瓊脂粉末狀態培養基等。

2. 活組織培養基：如雞胚等，用于培養病毒等寄生微生物。

3. 無機鹽培養基：專用于自養微生物培養。